晴霁之后，定是菜花盛开的好天气（晴菜花）

到这场雨结束为止，一直都在等待着你

主人公・藤宮晴真 （ふじみや はるま） 是，上奈木（かみなぎ）学园的二年生。
已经决定好升入高年级的春假。 晴真却因为不明原因发起高烧，不得不入院治疗一个月。

接下来，5月──
晴真的身体完全康复，回到了学园，却因为班级的更替无法和新的同学们相处，成为了在班级中被孤立的存在。
另一方，数日前转校而来的菜乃花 （なのか） 也是，没有交到朋友。
座位很近的缘故，互相打了招呼，谈论彼此的身世之后，两人开始变得意气相投。

随后晴真听闻，菜乃花想要加入 “园艺部” 的消息。
不过，园芸部在一年以前就废部了。
晴真为了实现菜乃花的希望，许下了协助她设立园艺部的誓言。
以此为契机，晴真和更多的朋友相遇，取回了失去的 “一个月的时间” 。